Der Einsatz im Garten- und Obstbau ist die ursprüngliche Verwendung von effektiven Mikroorganismen, denn sie wurden für diesen Bereich entwickelt. Das Urprodukt EM1® bildet auch heute noch die Basis aller EMProdukte für den Garten. Effektive Mikroorganismen unterstützen die Pflanzen beim Wachstum und der optimalen Entwicklung. Robuste Pflanzen können sich selbst optimal vor Schädlingen schützen. Von der Keimung über die Wurzelbildung und Blüte bis hin zur Reifung fördern EM-Produkte die Pflanze. Neben lebenden Mikroorganismen versorgen einige Produkte den Boden auch mit wichtigen Nährstoffen und dienen somit zugleich der Verbesserung der Bodenqualität und Düngung. Der physikalische, chemische und biologische Zustand des Gartenbodens wird positiv beeinflusst und auch die Kompostierung wird beschleunigt.